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Geneious

满足世界领先的生物信息学软件平台

Geneious是由Biomatters开发的一款分子生物学和NGS分析软件，该软件包括从基础的分子生物学到序列分析的工具，特别适用于诊断抗体研发生物信息学软件方案。Geneious给予组织所需的所有分子生物学和序列分析工具。无论您是希望提高生产率、提高可见性和洞察力，还是减少错误和风险，我们的平台都会解锁您实验室数据的价值。

序列分析

Sanger和 NGS的可视化（宏基因组、RNA-seq），序列拼接，查找SNP，基因组注释，DNA序列及蛋白质序列的统计、预测等，查找Motif、ORF，比对序列与懂球帝app官网构建进化树等功能。

自动基因组注释根据公共或本地数据库中的现有模式和注释自动注释新基因组，包括根据这些模式将 ORF 注释为假设基因，并针对 NCBI 进行查询。
	实时序列预测对DNA和蛋白质序列进行翻译，预测分子量、等电点、疏水性、跨模结构域等。
NGS可视化只需单击一下，即可取得您拥有的下一代测序数据所需的可视化效果。注释的基因组，循环基因组，映射的读取，重叠群都显示在我们高度可定制的序列视图中。选择要显示的其他批注的配色方案、图形和轨迹，然后使用动态批注搜索和位置跳转来查找所需内容。
	转录组数据分析从映射的读数中计算表达水平，然后在样品之间进行成对比较，以鉴定差异表达的基因。在统计编程语言R方面没有任何专业知识的情况下，使用行业标准的DESeq2包来比较两个条件之间的表达式，每个条件都有重复样本。切换到 PCA 图选项卡以使用主成分分析检查数据的质量，然后切换到交互式火山图以发现感兴趣的基因。在火山图中选择一个基因后，您可以在序列视图中直接跳转到该基因，其中所有基因都具有基于差异表达的热图着色。
序列拼接可以处理来自任何类型的测序机器的数据，读取任何长度的读数，包括配对读取和来自不同测序机器的混合读取。它特别适用于具有产生圆形重叠群的独特能力的微生物组件。
	序列比对使用如Clustal Omega、MUSCLE、MAFFT等多种比对方式将序列进行对齐分析。
系统发育进化树构建使用多种算法对目的序列构建进化树，如MrBayes、Neighbor Joining、UPGMA、PhyML。